¿Cambia algo en mi aplicación de WhatsApp Business en el celular?

No, tu aplicación seguirá funcionando de la misma manera. La única diferencia es que ahora contarás con automatizaciones que optimizan la gestión de mensajes, pero toda tu información y conversaciones se mantendrán sin cambios. 

Se recomienda no vincular tu número personal, ya que las automatizaciones y respuestas del negocio podrían mezclarse con tus conversaciones personales.